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《自然》:北大科學家肝癌大揭秘!百萬細胞大測序,鑑定5種腫瘤微環境,並釐清促癌中性粒細胞的多種機制

由 奇點網 發表于 攝影2023-01-08
簡介這次,北京大學的張寧團隊、張澤民團隊、朱繼業團隊共同合作,基於患者樣本以及小鼠樣本進行單細胞RNA測序分析,定義5種肝癌免疫微環境亞型,同時還揭示腫瘤相關中性粒細胞在肝癌進展中的意義,發現中性粒細胞耗竭可以減輕腫瘤負荷,抑制小鼠肝癌進展[2

中性細胞比值低是怎麼回事

*僅供醫學專業人士閱讀參考

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原發性肝癌(PLC)是全球癌症相關死亡的第三大原因,常見型別包括肝細胞癌(HCC)、肝內膽管癌(ICC)以及HCC-ICC的混合型(CHC)[1]。

然而目前,

肝癌治療手段有限,阻擋在其機制研究和精準治療道路上的一大絆腳石,便是腫瘤免疫微環境(TIME)的異質性

[1,2]。

這次,北京大學的張寧團隊、張澤民團隊、朱繼業團隊共同合作,基於患者樣本以及小鼠樣本進行單細胞RNA測序分析,

定義5種肝癌免疫微環境亞型,同時還揭示腫瘤相關中性粒細胞在肝癌進展中的意義,發現中性粒細胞耗竭可以減輕腫瘤負荷,抑制小鼠肝癌進展

[2]。

文章於近日發表在頂刊《自然》上。

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論文首頁截圖

TIME中異質性由免疫細胞、基質細胞共同決定,是腫瘤轉移、復發、耐藥的主要因素之一。

如果能夠充分地瞭解原發性肝癌的TIME異質性,便可以透過識別生物標誌物來更好地對患者進行分層,實現精準化治療

[1,2]。

在這項研究中,張寧、張澤民、朱繼業和他們的團隊先是收集來自124名經初次治療的原發性肝癌患者的160個樣本進行單細胞RNA測序(scRNA-seq),繪製了大規模人類肝癌單細胞圖譜。

根據分析結果,他們從獲得的這1092172個細胞中,

共鑑定出89個肝癌TIME細胞亞群

。同時還發現,這些細胞亞群在不同患者之間存在特異性,並表現出明顯的組織和腫瘤型別偏好。

透過對這些細胞亞群進行層次聚類分析,以及根據其功能標記基因表達情況、預後相關性等特徵進行考慮,研究者們定義了5種肝癌TIME亞型,分別為:

免疫啟用型:TIME-IA

(Immune Activation);

髓系富集免疫抑制型:TIME-ISM

(Immune Suppressive Myeloid);

基質富集免疫抑制型:TIME-ISS

(Immune Suppressive Stromal);

免疫排斥型:TIME-IE

(Immune Exclusion );

免疫駐留型:TIME-IR

(Immune Residence)。

他們將這一亞型分類系統命名為

TIMELASER

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圖1:TIMELASER

基於TIMELASER,研究者們對患者進行分層,以觀察不同TIME亞型與無進展生存期(PFS)之間的關係。

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圖2:5種TIME亞型與PLC患者PFS之間的關聯

不僅如此,研究者們還探索了TIME中的趨化因子、細胞因子及其受體的表達模式。結果顯示,

這5種不同TIME亞型表現出不同的趨化因子網路,並且與腫瘤細胞的轉錄組特徵相關

由於

在髓系富集免疫抑制型TIME中觀察到有多箇中性粒細胞亞群富集

,再加上髓系富集免疫抑制型TIME

與患者的不良預後相關

(見圖2),中性粒細胞究竟與肝癌進展之間存在哪些關聯,引起了研究者們的注意。

根據分析結果,研究者們

共鑑別出11箇中性粒細胞亞群,其中有3個亞群富集於外周血、2個亞群富集於肝癌癌旁組織、6個亞群富集於肝癌腫瘤組織中

,也就是腫瘤相關中性粒細胞(TANs)。

具體來看,這些

腫瘤相關中性粒細胞以不同機制促進肝癌進展

。比如CCL4

+

TANs(Neu_11_CCL4),能夠高表達趨化因子CCL3和CCL4,並

透過分泌CCL3、CCL4來招募腫瘤浸潤性巨噬細胞

;而另一方面,PD-L1

+

TANs(Neu_09_IFIT1)則高表達免疫檢查點PD-L1,並

透過PD-L1來抑制外周血CD8+T細胞的抗腫瘤毒性功能

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圖3:PD-L1

+

TANs抑制CD8

+

T細胞的增殖能力和毒性功能

那麼,是否能夠以這些腫瘤相關中性粒細胞為突破口,阻止肝癌進展呢?

於是,研究者們進一步構建了2種自發性肝癌小鼠模型(分別為肝細胞癌、肝內膽管癌),並使用

靶向中性粒細胞特異性標誌物Ly6G的抗體(抗Ly6G抗體)

治療,來消耗肝癌小鼠的中性粒細胞。

結果顯示,在接受抗Ly6G抗體治療後,小鼠體內有70%的腫瘤相關中性粒細胞發生耗竭。與對照組相比,

抗Ly6G抗體治療的小鼠腫瘤重量顯著減少,而且中性粒細胞對T細胞毒性功的抑制作用、對巨噬細胞的招募作用減弱,腫瘤浸潤性巨噬細胞數量減少46.6%,PD-L1表達量也發生下調

另外研究者們還發現,肝癌小鼠在抗Ly6G抗體治療的過程中,

腫瘤相關中性粒細胞的組成結構也在發生改變

。儘管大多數腫瘤相關中性粒細胞亞群的數量是在減少,但是小鼠腫瘤中的Neu_09_Apoa2(對應人類的Neu_07_APOA2)數量相對提高。

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圖4:使用抗Ly6G抗體減少中性粒細胞,可以抑制小鼠肝癌進展

總體來說,

張寧、張澤民、朱繼業帶領他們的團隊揭示5種肝癌免疫微環境亞型,並在這個過程中發現中性粒細胞與肝癌進展之間的關係。更重要的是,肝癌小鼠實驗結果表明,消耗中性粒細胞則可有效抑制腫瘤進展

對此研究成果,研究者們表示,這次發現腫瘤相關中性粒細胞透過表達CCL4、PD-L1來促進腫瘤進展,這意味著

無論是單獨使用還是與免疫檢查點抑制劑聯合使用,腫瘤相關中性粒細胞都是很有前途的免疫治療靶點

。未來將進一步從中性粒細胞身上,為肝癌治療找到新的解題方案。

參考文獻:

[1]

Tang M, Zhao Y, et al。 Liver cancer heterogeneity modeled by in situ genome editing of hepatocytes。 Sci Adv。 2022 Jun 24;8(25):eabn5683。 doi: 10。1126/sciadv。abn5683。 Epub 2022 Jun 22。

[2]https://www。nature。com/articles/s41586-022-05400-x

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本文作者丨張艾迪