清朝與明朝的立國基礎不同，明朝是“驅逐韃虜，恢復中華”，其本身是一個漢民族政權，對蒙古人只是驅逐；而清朝則不同，清朝是滿蒙漢一體（比如其八旗兵既有滿八旗，也有漢八旗和蒙八旗），尤其是滿蒙一體是清朝的立國之基。

1，清朝取得對蒙古的宗主權尚在入關之前

公元1635年，當清朝還是後金的時候，皇太極便擊敗了漠南蒙古的林丹汗，這是大蒙古國的最後一任大汗，雖然事實上只能統領漠南蒙古，但名義上仍是整個蒙古的大汗。

這一年之後，林丹汗的兒子將傳國玉璽交給皇太極，從此皇太極兼任蒙古大汗，此後清朝的皇帝便也是蒙古人的大汗，滿蒙一體的格局開始形成。

2，康熙帝征服漠北蒙古

明清之際的蒙古人分為三部：漠南、漠北、漠西。漠南即內蒙，漠北即外蒙，漠西蒙古則在西域。

清朝皇帝成為蒙古人大汗之後，漠北蒙古後來承認了這一事實，以1691年的多倫會盟為標誌，康熙帝將漠北蒙古納入了帝國版圖。

可是，漠西蒙古，尤其是其中的準噶爾部不承認清朝的宗主國地位，準噶爾部的噶爾丹甚至有一統蒙古、重現成吉思汗輝煌的志向，這與清朝便產生了不可調和的矛盾。

3，清朝向西，準噶爾向東

在清朝皇帝眼中，不承認自己宗主國地位的準噶爾汗國無疑是叛亂；而從準噶爾的角度來說，一統蒙古便首先要向東拿漠北蒙古開刀。

於是，接下來朝只有戰爭，這便是康熙帝一定要親征噶爾丹的原因所在。

滿蒙一體的歷史格局，至清朝滅亡也不曾改變，所以清朝是不會放棄蒙古三部的。

4，清朝一統蒙古三部用了120多年

康熙帝雖然擊敗了噶爾丹，但準噶爾汗國並未滅亡，後來甚至又捲土重來。

至公元1759年乾隆年間，清朝才徹底滅了準噶爾汗國，並將準噶爾部屠戮殆盡，客觀上使西域變成了“回疆”。

公元1635-1759年，124年的時間，歷皇太極、順治、康熙、雍正、乾隆五代帝王，蒙古三部最終全部納入了大清帝國的版圖。

因此，清朝一定要滅準噶爾汗國的原因是其滿蒙一體的國策所決定的，而準噶爾汗國想要恢復蒙古祖上輝煌的夢想則註定了二者只能刀兵相見。