因為被黑暗組織灌下毒藥身體變成小學生的高中生偵探工藤新一化名江戶川柯南一直寄住小蘭家中，並幫助小蘭的父親毛利小五郎破獲了很多案件，但是誰也沒想到這一天天才偵探柯南也遭遇了綁架，雖然過程驚險，結局卻有驚無險。

這一天一個名為江戶川文代的胖女人來到毛利小五郎的事務所，謊稱自己是柯南的母親，並將其接走，路上柯南質問她到底是誰，沒想到女人不僅說出了他工藤新一的身份並且一一細數他父母的往事，這可把柯南嚇壞了，他意識到眼前的女人很可能是黑暗組織的成員，自己的身份也已經暴露，情急之下，柯南跳出車門想跑到阿笠博士家中共商對策。

萬萬沒想到在阿笠博士家門口再一次被女人綁架。

柯南被綁到一個黑暗的房間，等他醒來從縫隙中看到女人在和一個帶恐怖面具的男人對話。對話中出現組織，毒藥等內容，柯南意識到這是組織的成員找到了他，想要將他滅口，柯南急中生智躲到了暗格裡，完美騙過女人和戴面具的男人。

等到兩人離開，柯南從暗格中逃出，回憶起剛剛兩個人的對話，得知他們很可能要去進行一場交易，並會在交易中會殺死對方，柯南憑藉偵探的頭腦尋找線索，透過線索得知他們將在米花大飯店301房間進行交易。

柯南追蹤到米花大飯店301房間並用一塊口香糖順利潛入，不想這一計謀瞬間被面具男人識破，面具男人從衣櫃中找到藏身的柯南，並用槍指著他的頭，眼看柯南要被殺死，沒想到隨著槍裡發出的竟是玩具，這時，面具男人和胖女人哈哈大笑著脫掉偽裝，偽裝下竟然是柯南的父親和母親。

沒想到一向沉穩的柯南，其父母竟是這樣的童心未泯，讓所有柯南粉虛驚一場。

最後新一的母親將新一送回小蘭家裡的時候還不忘了助攻兒子，這樣的母親真的是漂亮又可愛。