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青蛙有了蛇的基因,是蛇出了軌?還是蛙劈了腿?水平基因轉移頂罪
青蛙有什麼說法
在印度洋西安的非洲島國馬達加斯加,有超過九成的青蛙都存在有蛇的基因Bovine-B(BovB)
。親生骨肉竟然有了“隔壁老王”的血統?這究竟是蛇出了軌,還是青蛙劈了腿?還是傳說中遙遠而又神秘的“水平基因轉移”惹的禍呢?
水平基因轉移是蛇與青蛙的案件的罪魁禍首
當地蛇的一段基因BovB有著強大的能力——將自己的DNA點位複製到其他位置上。這種移形換影、移花接木的一招確實厲害,從蛇的身上水平轉移到了寄生蟲、水蛭等物種的轉移下,進入到了青蛙體內。
這肯定不是一代蛇或者一代蛙能夠完成的任務,在馬達加斯加這樣相對封閉的環境裡,經過長年累月的發展,才鑄就今日的情形。
生命延續 基因傳遞
在我們通常的認知裡,基因是一條具有雙螺旋結構的DNA片段,通常都是由父母雙方各出一條,然後傳給子代,形成下一代的基因。在不斷地繁衍、組合中,基因不斷演繹變化,但也在大體上保持了主要的資訊,將種族特性一代代傳遞下去。
在一代代的繁衍中,難免會出現一些基因變異,於是就出現了生物的多樣性。但在我們常規的概念中,這種變異發生的機率很低,而且大部分變異在自然的優勝劣汰中被篩選掉了。因此生物的演化總是要經過漫長的時間。想要出現大量的變異人種,只有在漫畫影視《X-man》中才會存在。
然而,大自然的神奇遠遠超乎於人類的想象。
“盪漾在進化樹枝間的猴子”
在我們的常規印象中,所有生物都是起源於最初的有機多分子體系演化而成的原始生命。隨著生物個體間的不同進化路線分出了動物、植物,然後又細分出了門、綱、目、科、屬、種等不同的分支。不同物種間的DNA就是沿著這些分支不斷演化傳遞下去的。
在這看似“完美”的解釋之下,卻出現了不按常理出牌的怪胎——盪漾在進化樹間的猴子。科學家們研究發現,
基因除了常規的垂直傳遞外,還有“水平基因轉移”這種形式存在!
這種跨越物種的移動形式就如同一隻不安分的猴子,在不同的進化樹之間跳來跳去。
溶菌酶基因GH25
在進化樹分支的底層是菌類、病毒、動物、植物等基礎的分支,通常走向這幾種分支的生物是井水不犯河水,朝著各自的方向繁衍下去。但是卻有一種溶菌酶基因GH25遊走於各個物種之間,出現在多個分支上面。
科學家最初發現GH25時,它還只是一段平平無奇的基因片段,它可以產生一種溶菌酶,破壞細菌的蛋白質外殼。有了它的存在,某些病毒就可以攻擊細菌。相應的病毒就可以繁衍了。
然後,科學家們又發現某些
細菌的DNA中也有GH25的存在,當細菌進行分裂時,GH25產生的溶菌酶可以把細菌自身的蛋白質外殼分解掉
,相當於“自毀長城”。但也正因如此,這個細菌就可以進行正常的分裂繁殖了。
如果說以上的功效還算是常規操作,那麼事情接下來的發展就出乎人們意料了。
美國反而比爾特大學的研究團隊在基因資料庫中查詢GH25的蹤跡,竟然發現在很多非細菌生物中也有它的存在!
除了像厚壁菌這樣的細菌外,米麴黴、豌豆蚜蟲、江南卷柏以及一些深海古菌中都出現了GH25的身影
。
要知道,這麼多種生物可是分別隸屬於三大生物界,而且其中的
豌豆蚜蟲、江南卷柏祖先都不具備該段基因。
實驗室主任Seth Bordenstein賽斯·波丹斯坦驚歎:一組基因出現在三大生物界,這不但拓展了生物界限,更拓展了人類對生物認知的邊界!
基因組學家Olivier Panaud奧利維爾·帕諾德在研究GH25基因段的時候就發現,這段基因神出鬼沒,生物基因進化的複雜程度遠遠大於人類的認知。
究竟GH25是如何做到突破生物界限實現水平轉移的呢
?
病毒結構簡單,想要突破它的DNA不難。透過病毒的幫助,改變細菌的DNA,實現水平轉移也並非難事,但是想要攻克其它物種的堅固堡壘,可就不難麼容易了。
法國里昂第一大學生物統計學研究者Vincent Daubin 文森特·多賓指出了一條道路:
當生物進食的時候,該食物恰好包含某個細菌的DNA片段,基因水平轉移就可能出現了
。這種機率就相當於一個人吃飯時恰好吃到了一張彩票。雖然機率很低,但只要經過大量的嘗試,經過無數次失敗之後,總會有成功的一天。
而且GH25本身的特性有助於生物對抗細菌,其中
深海古菌就利用GH25產生的溶菌酶抵擋住了四波細菌的進攻。
這樣一來,凡是被GH25改變基因的生物都具備了更強的抗菌性,更容易存活下來,從而被後世的人類發現。
GH25只是基因水平轉移的其中一個例子,與之類似的案例還有很多。
基因水平轉移不止一個片段
範德比爾特大學的團隊Rokas和Slot發現在數百萬年前的麴黴屬中有23個基因片段出現在了柄孢殼菌屬的DNA之中
。如此大規模的集體遷移,再次重新整理了人類的認知。
隨著研究的深入,越來越多的成果被發現。
來自浙江大學昆蟲科學研究所的中國學者們在世界頂級期刊Cell《細胞》上發表論文:在218個高質量的昆蟲基因組中使用高通量篩選演算法,鑑定到1410個水平轉移基因
。
要知道,
昆蟲作為最繁茂的種群,早在4.8億年前就已經出現在地球上了
。豐富多樣的習性是不同昆蟲間的巨大差異,可是這些水平轉移基因居然跨越了這些差異,出現在眾多的昆蟲之中。
當然,如此大規模的基因水平轉移絕非偶然,它們的出現必定有存在的理由。研究者們透過對比實驗發現,
在擁有這段基因的蝴蝶或蛾子中,雄性對雌性的求偶行為更加強烈了
。換成大白話來講,就是有了這段基因的存在,那些常年母胎單身的鋼鐵直男們,有了這段基因片段後,終於開竅了,懂得如何去追女孩子了。
讀到此處的單身人士是不是已經在懷疑,自己體內缺乏了這段基因呢?
其實大可不必擔心。目前科學研究者們對基因水平轉移的研究還沒能證實這一點,找不到物件的問題不能怪自己的基因。
基因水平轉移會波及人類嗎?
不過,又有另一部分讀者可能會擔心了,自己的基因會不會被進行基因水平轉移,自己的基因是否會被破壞呢?畢竟現在很多食物都是轉基因了嘛。
其實這方面也不必過於擔心。基因水平轉移常常發生在微生物領域,因為在細胞層級,一道細胞膜就擋住了大量的外來基因片段。因此在這個層級上,基因水品轉移的活力就被大大限制了。
在人體這樣大型的生物體內,身體細胞還會產生逆轉錄酶,把外來的DNA、RNA片段裁剪掉。畢竟,一段基因水平轉移進入人體就已經是小機率事件了,再透過一小段基因片段就想改變真個人體的DNA,也太難為這段小小的基因了。
所以,一對夫婦產下的孩子,竟然會有隔壁老王的基因,大機率不會是基因水平轉移的問題。這個鍋,基因不背。
近些年來,隨著科研的不斷深入,人們逐漸意識到基因水平轉移這一現象,並且它發生的頻次比我們想象的要多。這隻頑皮的猴子不斷穿梭在生態進化樹間。它的存在讓我們的自然界更加的複雜,更加的豐富。當基因水平轉移這隻頑皮的“猴子“再次反覆橫跳,就會把DNA片段帶到更多的生物進化分支上去,讓這棵樹結出更多奇異的果子,讓世間的物種更加豐富多樣。
作者:方驥 校稿:川川