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Cell:首個泛癌症真菌生物組圖譜誕生!
真菌圖片檢查是什麼
在結直腸癌患者中發現真菌感染
一個多世紀以來,科學家們一直在探索
癌症
與
微生物
(如細菌和病毒)之間的聯絡,但鮮有研究關注
真菌
與癌症的關係
。最近幾年的大部分研究都聚焦在了整個人類微生物組上,特別是腸道,因為腸道中的細菌、病毒和真菌比人體其他地方的更為豐富且更加多樣化。
然而,與癌症相關的真菌發揮的
作用和
影響在很大程度上仍是未知的。
真菌是比細菌和病毒更復雜的真核生物;
而且,與細菌或病毒相比,含有細胞核的真菌與哺乳動物的細胞更為相似。
北京時間9月30日,發表在
《Cell》
上的一項最新研究中,來自
魏茨曼科學研究所和加州大學聖地亞哥分校的研究人員基於對35種癌症及其相關真菌的調查,全面繪製了首個泛癌症真菌生物組圖譜。
眾所周知,癌細胞與微生物有著長期而持久的聯絡。它們在人體的生態系統中共同進化,競爭共享資源。這一過程中甚至會決定癌細胞、微生物和人類宿主的生存問題。
此前的研究已經發現,真菌核酸存在於大多數人類癌症中。然而,真菌是如何進入腫瘤細胞的一直是個懸而未決的問題。但它符合包括腸道、口腔和面板在內的
全身
健康微生物組模式,細菌和真菌在這些地方相互作用,成為複雜菌群的一部分。
在人體上發現的真菌主要有兩種型別:一種是
環境真菌
,如酵母和黴菌。對於健康人來說,它們通常是無害的;另一種是
共生真菌
。它們生活在人體面板或體內,對人體有一些益處,如改善腸道健康;當然,也可能是有害的,如酵母感染或導致肝臟疾病。真菌也在塑造宿主免疫力方面發揮作用,這在免疫功能低下的人(包括癌症患者)中顯得尤為突出。
在這項新研究中,該團隊在4個獨立佇列涉及35種癌症的17401個患者組織、血液和血漿樣本中全面描述了與癌症相關的真菌菌群。他們發現,
在許多主要的人類癌症中,真菌DNA和細胞的丰度較低,並且真菌菌群的組成會因癌症型別而異。
真菌是未得到充分研究但極其重要的共生/機會性病原體,它們可以塑造宿主免疫力並感染免疫功能低下者。因此,應更好地探索真菌對人類健康的潛在影響,並透過微生物組視角重新檢查已知幾乎所有關於癌症的東西。
研究人員在腫瘤中檢測到多種
真菌-細菌-免疫生態
。對真菌菌群與匹配的細菌組(微生物組的細菌組成)和免疫組(構成免疫系統的基因和蛋白質)進行比較的分析顯示,
它們之間的關係通常是共生而不是競爭的
。
例如,一種真菌在50歲
以上患者的乳腺癌腫瘤中富集,而另一種真菌在肺癌樣本中顯著富集。
此外,
特定真菌與年齡、腫瘤亞型、吸菸狀況、對免疫治療的反應和生存措施之間存在顯著相關性。
然而,這些真菌只是單純相關還是因果相關還有待進一步確定。
該團隊表示,這些發現證實微生物組在整體上是癌症生物學的一個關鍵部分。因此,這項研究可能提供了重要的轉化機會,不僅在癌症檢測方面,還可以在與藥物開發、癌症進化、疾病後遺症、復發和伴隨診斷相關的其他生物技術中應用。
論文連結:
https://dx。doi。org/10。1016/j。cell。2022。09。005